1)气源系统
2)进样系统
引入试样，并保证试样汽化，有些仪器还包括试样预处理装置，例如热脱附装置（TD）、裂解装置、吹扫捕集装置、顶空进样装置。
3)柱系统
试样在柱内运行的同时得到所需要的分离。
4) 检测系统
对柱后已被分离的组分进行检测，有的仪器还包括柱后转化（例如硅烷化装置、烃转化装置）。
5) 数据采集及处理系统
采集并处理检测系统输入的信号，给出最后试样定性和定量结果。
6)温控系统
操纵并显示进样系统、柱箱、检测器及辅助部分的温度。
所有的气相色谱仪都需包括以上六个基本单元，其功能都相同，差异的只是水平的配置，因此全面了解各单元的组成功能对仪器使用、开发及故障的分析排除都是必要的。下面分别介绍气路系统、进样系统和检测系统，柱系统和数据采集处理系统。
气路系统
气相色谱法是利用各组分沿色谱柱运动时，组分在柱内固定相与流淌相间反复多次进行分配，多次分配差异的累积就将各组分分开，所以载气不仅是推动组分在柱中运行的动力，而且也参加组分的分离过程。在检测器中，载气也直接影响组分信号的检测，例如热导检测器的检测原理是载气携带组分进入热导池时，池内气体组成发生变化，其热导率也相应改变。热敏元件的热平衡被破坏，引起热敏元件的阻值的变化，惠更斯电桥就输出电压不平衡的信号，通过数据采集系统就得到组分的色谱峰。所以载气不仅作为柱分离的动力，而且参加柱的分离过程和组分的检出过程。辅助气直接进入检测器，同样也会影响检测的结果。因此一个成功的分析方法不仅要考虑到气流的稳压和流量的操纵，而且需考虑到载气和辅助气的选择和净化，以保证GC分析质量和分析结果的稳定性；延长柱寿命和减少检测器的噪声提高检测的灵敏度。
气源系统
它的作用是提供足够压力的气源。例如：钢瓶、空气泵、气体发生器。

通常使用钢瓶，但近几年气体发生器的使用逐年增多，发生器供给的典型的氮气纯度为O2<2～3μl/L，露点低达—56～700C。典型的H2纯度为99.99% ；典型的气体流量：H2和O2为0～300ml/min；空气为0～3000ml/min；工作压力为0～0.4MPa。这些发生器可以满足一般气相色谱分析对气体的要求，更高的要求就必须采纳进口的发生器。例如安捷伦公司PARKER公司生产的气体发生器：纯净氢纯度可达99.99999%；超纯氮纯度99.9995%～99.99999%；空气中杂质小于0.1μl/L（按甲烷计）。